厦门特殊样本RT-PCR检测技术研究方案

Real-time PCR：实时荧光定量PCR是目前确定样品中DNA(或cDNA)拷贝数较敏感、较准确的方法。如果用于RNA检测，这被称为逆转录实时PCR即（Real-timeRT-PCR）是实时PCR法，它是指对DNA或经过反转入（RT-PCR）的RNA通过聚合酶链式反应并实时监测DNA的放大过程，在扩增的指数增长期就测量扩增产物，因为扩增指数增长期测量值与特异DNA（RNA）起始量存在相关性，从而实现定量检测。Real-time PCR的基本目标是精确测量和鉴别非常微量的特异性核酸，从而可通过监测CT值而实现对原始目标基因的含量定量。实时荧光定量PCR法较大的优点是克服了终点PCR法进入平台期或叫饱和期后定量的较大误差，实现DNA/RNA的精确定量。该技术不单单实现了对DNA/RNA模板的定量，而且具有灵敏度和特异性高、能实现多重反应、自动化程度高、无污染、实时和准确等特点，该技术在医学临床检验及临床医学研究方面有着重要的意义。聚合酶链式反应准备：PCR所用的酶主要有两种来源：Taq和Pfu，分别来自两种不同的噬热菌。厦门特殊样本RT-PCR检测技术研究方案

Real-time PCR链式反应的特点：灵敏度高：PCR产物的生成量是以指数方式增加的，能将皮克(pg=10-12）量级的起始待测模板扩增到微克（μg=-6）水平。能从100万个细胞中检出一个靶细胞；在病毒的检测中，PCR的灵敏度可达3个RFU(空斑形成单位）；在细菌学中很小检出率为3个细菌。简便、快速：PCR反应用耐高温的TaqDNA聚合酶，一次性地将反应液加好后，即在DNA扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应，一般在2～4小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析，不一定要用同位素，无放射性污染、易推广。纯度要求低：不需要分离病毒或细菌及培养细胞，DNA粗制品及RNA均可作为扩增模板。可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等DNA扩增检测。武汉微量Real-time PCR供应商聚合酶链反应的试剂应分配到一次性的等分试样中。厦门特殊样本RT-PCR检测技术研究方案聚合酶链式反应：模板的制备，PCR的模板可以是DNA，也可以是RNA。

Real-time PCR从用途上分可以分为定性分析和定量分析：定性分析指的是用于分析待检测的样本中是否存在我们想要检测的成分，即待检测成分有无的分析。通常，定性分析可以应用于病毒以及病原菌的检测，物种鉴定以及基因分型等。病毒及病原菌检测，如SARS、H1N1病毒，都可以通过Real-time PCR的方法进行高灵敏度的检测，定性分析样本是否已被病毒传播。物种鉴定如我们国家的一些检验检疫机构，想要检测进口的牛肉制品中是否含有鸡源、猪源或鸭源等成分，或者用于检测羊奶中是否会掺有牛奶等等，可以通过Real-time PCR的方法进行检测。基因分型，如啤酒型，肥胖型基因的检测，就是Real-time PCR在基因分型方面的应用。

引物的设计对于这个实验至关重要，因为Real-time PCR的检测灵敏度比较高，所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道，还有几点必须注意：1，引物的错配率（引物错配形成引物二聚体，但是SYBR照样能嵌入进去，结果导致实验结果的误差很大，重复性也不好）。2，引物的特异性一定要高（不像常规PCR，引物同源性不高，只要两条产物的片段长度相差足够大，在电泳的时候能够区分开就可以。Real-time PCR只有在熔解曲线的时候能分开，所以这就造成整个实验结果误差很大，不可信）。热启动聚合酶链式反应可以通过将反应组分加热到变性温度在加入聚合酶之前。

Real-time PCR探针法适用于：1、具有高适应性和可靠性，实验结果稳定重複性好，特异性更高。2、适用于扩增序列专一的体系的检测。3、样品中靶基因含量过低的定量PCR检测。4、靶基因的特异序列较短，无论怎样较佳化引物设计条件都不能解决。5、存在与靶基因同源的序列，在PCR中容易出现非特异性扩增，对特异性要求较高的定量。6、普遍用于人类传染病的诊断和病原定量,在动物病原体基因的检测,畜禽产品的检验检疫,生物製品的鉴定。Real-time PCR探针法:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的萤光探针，该探针为一寡核苷酸，两端分别标记一个报告萤光基团和一个淬灭萤光基团。探针完整时，报告基团发射的萤光信号被淬灭基团吸收；PCR扩增时，Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解，使报告萤光基团和淬灭萤光基团分离，从而萤光监测系统可接收到萤光信号，即每扩增一条DNA链，就有一个萤光分子形成，实现了萤光信号的累积与PCR产物形成完全同步。因为Real-time PCR的检测灵敏度比较高，所以相应的对引物设计的要求就很高。苏州分子生物学荧光PCR原理

PCR可能是分子生物学中使用很较广的技术。厦门特殊样本RT-PCR检测技术研究方案

Real-time PCR相对定量中的标准曲线法如何进行：主要是相对定量标准品的制作，一般有三种方法：1、比较复杂的方法：质粒，采用Biotnt提供内参基因的特异性Real-time PCRmRNA引物，对目的基因进行Real-time PCR实验，得到PCR扩增产物；PCR扩增产物转入质粒中，得到相对定量的标准品；2、一般采用的方法1：比较强的CDNA模板，3、一般采用的方法：PCR扩增产物，如果在方法2中找不到比较强的CDNA模板，则选用PCR产物作为相对定量的标准品也是可以的；需要注意的事项是：PCR产物浓度很高，而Real-time PCR的产物片段比较短，容易在稀释的过程中造成PCR污染，要注意操作。厦门特殊样本RT-PCR检测技术研究方案

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