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厦门细胞荧光定量PCR研究方案

来源: 发布时间:2023年04月09日

内标在传统定量中的作用,由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重现性极差。同一个模板在96孔PCR仪上做96次重复实验,所得结果有很大差异,因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量。加入内标后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性。但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。内标对定量PCR的影响,若在待测样品中加入已知起始拷贝数的内标,则PCR反应变为双重PCR,双重PCR反应中存在两种模板之间的干扰和竞争,尤其当两种模板的起始拷贝数相差比较大时,这种竞争会表现得更为明显。但由于待测样品的起始拷贝数是未知的,所以无法加入合适数量的已知模板作为内标。也正是这个原因,传统定量方法虽然加入内标,但仍然只是一种半定量的方法。Real-time PCR技术已经被普遍用于监测细胞mRNA表达量的变化。厦门细胞荧光定量PCR研究方案

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实时荧光定量PCR:实时荧光定量PCR技术有效地解决了传统定量只能终点检测的局限,实现了每一轮循环均检测一次荧光信号的强度,并记录在电脑软件之中,通过对每个样品Ct值的计算,根据标准曲线获得定量结果。因此,实时荧光定量PCR无需内标是建立在两个基础之上的:Ct值的重现性PCR循环在到达Ct值所在的循环数时,刚刚进入真正的指数扩增期(对数期),此时微小误差尚未放大,因此Ct值的重现性极好,即同一模板不同时间扩增或同一时间不同管内扩增,得到的Ct值是恒定的。莆田组织荧光定量PCR供应商Real-time PCR探针法具有高适应性和可靠性。

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Real-time PCR从用途上分可以分为定性分析和定量分析:定性分析指的是用于分析待检测的样本中是否存在我们想要检测的成分,即待检测成分有无的分析。通常,定性分析可以应用于病毒以及病原菌的检测,物种鉴定以及基因分型等。病毒及病原菌检测,如SARS、H1N1病毒,都可以通过Real-time PCR的方法进行高灵敏度的检测,定性分析样本是否已被病毒传播。物种鉴定如我们国家的一些检验检疫机构,想要检测进口的牛肉制品中是否含有鸡源、猪源或鸭源等成分,或者用于检测羊奶中是否会掺有牛奶等等,可以通过Real-time PCR的方法进行检测。基因分型,如啤酒型,肥胖型基因的检测,就是Real-time PCR在基因分型方面的应用。

Real-time PCR操作流程:1、收集样品。2相关试剂总RNA提取试剂TREzolReagent(RNA提取试剂),M-MLV(cDNA逆转录酶),RNA纯化试剂,RealqPCRMasterMix(萤光定量PCR预混试剂)。3实验仪器萤光定量PCR仪;PCR仪;低温离心机。4总RNA提取。5cDNA合成在0.5ml的离心管中加入1µl模板总RNA(1µg/µl);Real-time PCR操作流程:2µl随机引物(T18,10pmol/ul);2µl10mMdNTPmix;加水至15µl体系。混匀后70℃变性RNA5分钟,冰上速冷1分钟,离心将溶液收集至管底加入6µl5×PCRbuffer;1µlRNaseout;1µlM-MLVRT;加水至30µl体系。PCR仪中反应条件设定37℃延伸60min,70℃保温15min终止反应。合成好的cDNA置于-20℃保存备用。Real-time PCR与普通PCR的实验目的不同,所以对引物的设计要求也不同。

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Real-time PCR原理:所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。DNA结合染料法,应用一种带有荧光的、非特异的DNA结合染料检测PCR过程中积累的扩增产物。检测所有双链DNA扩增产物,包括非特异反应产物,如引物二聚体。可对任何双链DNA进行定量;不需要探针,因此减少了实验设计及运转成本;适合于大量基因的分析;简单易用。实时荧光定量PCR:实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。聚合酶链反应允许快速生产短DN段,即使已知的引物序列不超过两个。南通细胞荧光PCR技术服务

实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。厦门细胞荧光定量PCR研究方案

Real-time PCR与普通PCR的实验目的不同,所以对引物的设计要求也不同。普通PCR的实验目的只是为了获得目的基因产物,允许有非特异扩增,只要目标条带清晰明亮,就可以通过切胶回收的方法回收目标条带,之后进行后续的克隆、测序。但Real-time PCR的目的是为了让目的基因按照理论值或是按照接近理论值进行扩增,只有这样的扩增后续由Ct值推算出的起始量模板量才准确,基于此,Real-time PCR对非特异性扩增和引物二聚体的存在有较严格的要求。厦门细胞荧光定量PCR研究方案

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