酶标仪有单波长和双波长检测功能。有时使用者不知在什么情况下使用单或双波长检测。所谓的“单波长”就是使用一种对显色具比较大吸收的波长即450 nm或492 nm进行比色测定；而“双波长”则除了用对显色具比较大吸收的波长即450 nm或492 nm进行比色测定外，同时用对特异显色不敏感的波长如630 nm进行测定，酶标仪打印出来的吸光度则为二者之差。630 nm波长下得到的吸光度是非特异的，来自于板孔上诸如指纹、灰尘、脏物等所致的吸收。因此，在ELISA比色测定中，比较好使用双波长，且不必设空白孔。云南操作简便酶标仪样品检测荧光酶标仪是用来进行荧光的检测。
在双波长测定中，减少了测定干扰和电路干扰，因此测定结果比单波长测量明显好转。由于液体表面张力的不同，导致单波长测定时的误差较大。并且用不同的洗涤剂会影响到加入底物和终止液后的液面情况，用加入表面活性剂的洗涤液清洗后，形成的液面更凹，对单波长检测的影响更大，并且与表面活性剂的浓度成正比。而且中性蒸馏水洗涤后，单、双波长检测的结果基本一致。利用双波长检测，不会影响检测灵敏度。建议在进行酶联免疫检测时，酶标仪比色应该优先双波长。这样可以提高临界值处标本的分析正确度，减少实验误差。
合适的软件功能对于ELISA定量测定同样很重要。有研究表明，四参数方程能较好地反映免疫测定的剂量反应曲线，*为适合于定量酶免疫测定的曲线拟合。因此，如目的是定量测定，则在酶标仪的软件功能中，要有这种曲线回归方程计算分析功能。其他诸如连点、直线等回归计算，则可根据酶标仪的应用目的而定，如兼用于微量生化测定，则此类回归计算就很有必要。此外，酶标仪兼做酶标动力学、凝集反应测定所需的软件是否应具备，当然也应根据使用目的而定。由于此类软件一般都较为昂贵，酶标仪常另外单独按需配备，如果不是实验室特殊需要，就不必强求这种软件功能。K3 Plus酶标仪可以通过USB接口连接打印机接口对读数进行处理。
酶标仪内置滤光片轮，可选择试验所需的不同波长的滤光片来进行分光。上海全自动酶标仪高清触屏
酶标仪的工作原理：使抗原或抗体结合到某种固相载体表面，并保持其免疫活性。使抗原或抗体与某种酶连接成酶标抗原或抗体，这种酶标抗原或抗体既保留其免疫活性，又保留酶的活性。用洗涤的方法使固相载体上形成的抗原抗体复合物与其他物质分开，结合在固相载体上的酶量与标本中受检物质的量成一定的比例。加入酶反应的底物后，底物被酶催化变为有色产物，产物的量与标本中受检物质的量直接相关,故可根据颜色反应的深浅进行定性或定量分析。由于酶的催化频率很高,故可极大地放大反应效果，从而使测定方法达到很高的敏感度。
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