青海FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学

大多数zhiliao抗体携带人 IgG1 骨架，双特异性或多特异性形式的开发正在迅速增加。此类抗体的分析需要特异性酶来表征特性，例如单价结合、二硫键扰乱和配对 Fc 糖基化。传统方案包括使用木瓜蛋白酶和 Lys-C 的酶消化，这需要优化以大限度地减少过度消化并获得足够的产量。Genovis的半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA （IgdE） 在铰链上方的一个特定位点消化人 IgG1，以产生完整的 Fab 和 Fc 片段。该酶在大多数人IgG1 上也具有活性，其中铰链区域以下的突变已被引入。为了证明FabALACTICA的性能，我们消化了不同的人IgG1抗体，并使用RP-HPLC分析了所得片段。用FabALACTICA消化后观察到的定义峰显示了不同人IgG1抗体的均质片段生成和强大的酶性能。FabALACTICA 酶也可用于生成完整的 Fc 片段。Genovis 酶产品，被世界各地的科学家使用，创新的产品形式促进了生物药物的开发和质量控制。青海FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学

不同于IdeS，Genovis的FabDELLO 是一种蛋白酶，可在铰链上方的单个位点消化人 IgG1，在两小时内产生完整的 Fab 和 Fc 片段，无需还原条件。该酶对具有突变铰链区域的抗体（如 LALA 突变）具有活性，并启用中级 LC-MS 来表征具有突变铰链的抗体的关键质量属性。FabDELLO 在铰链上方的单个位点消化人 IgG1 （...KSCDK / THTCPPCP...），生成完整的 Fab 和 Fc 片段。FabDELLO 是一种赖氨酸特异性蛋白酶。单个消化位点是人 IgG1 的三维结构的结果，使这种赖氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖，则Fc上暴露的赖氨酸处可能会出现额外的消化位点。FabDELLO在天然条件下具有活性，需要钙离子的存在。在37°C和pH 7-8.5下获得良好活性。FabDELLO 是从 Bdellovibrio 细菌克隆而来的，并在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签，分子量为 32 kDa。河南GlySERIASIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶Genovis的GingisREX （RgpB） 是一种精氨酸特异性蛋白酶。

蛋白酶用于生成肽，用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影，传统的蛋白酶并不总是理想的，因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶，可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比，所得肽更长，并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物，使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性，即使在长时间孵育过夜后，酶与底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性，但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1：20 和过夜孵育下，证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下，GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性，并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。

抗体 Fc 糖基化谱是一种重要的 CQA，因为它会影响疗效、和免疫原性。因此，需要从早期开发、工艺开发到质量控制和批量放行的整个过程对Fc聚糖谱进行监测。传统的分析方法基于对游离的聚糖进行荧光标记，然后通过HILIC-HPLC或CE进行分析，这需要多步骤的样品制备方案，这需要大量的时间和资源。使用Genovis的FabRICATOR MagIC酶解mAb，然后使用LC-MS进行中级分析，为Fc聚糖分析提供了一种快速、直接的替代方法。如上所示，它很容易实现自动化，以提高通量并降低处理错误的风险。小鼠 IgG1 在铰链下方具有不同的序列，不被 FabRICATOR Z 消化。

与IdeS不同，为了获得更均匀的度拉糖肽融合蛋白的消化产物，用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白质消化该蛋白质，该蛋白由与琼脂糖珠共价偶联的GlySERIAS酶组成。通过将酶偶联到树脂上，可以增加酶与蛋白质的比率，从而可以进一步加速反应，以获得更完整的连接子消化。此外，该酶不会存在于样品制备中，可能会干扰样品分析。为了进行比较，度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化过夜，或用GlySERIAS冻干1小时并在37°C下过夜消化。 为了降低样品复杂性，使用内切糖苷酶GlycINATOR冻干去除Fc聚糖，并减少链间二硫键。通过反相LC-MS对样品的分析表明，GlySERIAS Immobilized几乎完全消化了Fc结构域中的连接子，留下了接近均质的Fc/2产物，其中含有来自连接子的一个丝氨酸残基。用 GlySERIAS 冻干 1 小时或过夜消化，两者都会产生几种 Fc 产物，并附着不同数量的丝氨酸和甘氨酸残基。GLP-1肽在所有三个样品中以两种变体存在。使用GlySERIAS固定化消化的均质Fc/2能够详细研究特定于Fc区域的质量属性。此外，在样品中未观察到干扰分析的酶峰。作为补充，Fc/2 产物在用 GlySERIAS 冻干消化后残留部分连接子，有助于研究位于 GS 连接子的修饰。通过高分辨率质谱进行分离和鉴定：酶解曲线和更高的序列覆盖率。青海FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学

为Fc聚糖分析提供了一种快速、直接的、自动化，高通量的替代方法。青海FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学

对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用，需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段，但非特异性酶活性需要仔细优化，以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点，可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 （HOS） 的 NMR 研究、结合研究等。在这里，我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化，用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠，因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率，在加入SDS上样缓冲液之前，停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。青海FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学