Blinatumomab（一种对 CD19 和 T 细胞标志物 CD3 具有特异性的 BiTE 分子）的研究级生物仿制药在室温下用固定化过夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通过LC-MS对消解样品的直接分析表明，所有三个连接子区域均被消解，α-CD3 VL和VH链洗脱为一个色谱峰，α-CD19 VH和VL链作为单独的峰洗脱。来自连接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 结构域的小峰显示该短连接子未完全消化，表明 GlySERIAS 对短连接子的活性较低。与完整的蛋白质分析相比，四个结构域的分离提供了具有单同位素分辨率的高质量光谱。可以观察到每个结构域的几个不同变体，剩余的连接子残基数量不同。在色谱分离过程中，α-CD3 VH结构域无法从α-CD19 VH结构域完全基线分离，导致在相关质谱中观察到一些共洗脱。四个结构域的分离产生了有关在完整蛋白质水平上鉴定的蛋白质修饰位置的信息。例如，在完整水平上鉴定的 37 Da 的蛋白质修饰被分配给 α-CD3 VH 链。此外，240Da 和 320da 的两个修饰分别被分配给 α-CD3 VL 结构域。后者还含有一个带有五六个组氨酸残基的 His 标签。这些数据证明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 对包含多个柔性连接子蛋白进行质量控制的中级工作流程的强大功能。剩下一个连接子残基（甘氨酸残基），这有助于识别位于Fc区域的修饰。湖南GlySERIASIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
Genovis的FabRICATOR Fab2 （IdeS）试剂盒可消化兔 IgG，但要在亲和步骤中捕获 Fc 片段，您需要另一种填料，而不是试剂盒中通常包含的 CaptureSelect™ Fc。如果您对处理兔IgG感兴趣，请联系Genovis团队，我们将在FabRICATOR Fab2试剂盒中提供与兔Fc相容的树脂色谱柱。使用FabRICATOR的抗体消化的简单性、速度和可重复性也意味着这种酶可以被用于质量控制应用。 QC方法需要执行简单，易于训练，高度可重复，数据易于分析，这正是您使用FabRICATOR所得到的。 因为它适用于一系列不同的IgG，这也意味着使用FabRICATOR进行QC工作的客户将能够在未来的产品中使用它。 这显示了这种酶在抗体消化中是多么的有效。重庆FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学Genovis的FabULOUS来源于化脓性链球菌，在大肠杆菌中表达，分子量为 29 kDa，该酶含有 His 标签。
对于携带突变铰链的 Fc 融合蛋白或抗体来说，Fab 和 Fc 片段的生成可能具有挑战性。Genovis的GingisKHAN酶在铰链上方一个可触及的赖氨酸位点消化人IgG1，在足够温和的还原条件下保留链内和链间二硫键，从而产生完整的Fab和Fc片段。对于融合蛋白，消化通常在铰链上方获得，但融合伴侣的结构和氨基酸序列可能导致其他暴露的消化位点。如果去除保守的 Fc N-聚糖，Fc 中的第二个切割位点也可能被GingisKHAN酶切。将精选的单克隆人 IgG1 抗体和 Fc 融合蛋白与 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小时，并通过 HPLC 进行分析。
与肽图谱相比，根据Genovis科学家的经验，尤其是对于像抗体这样的分子，许多人在常规实验中做了太多的肽图谱，而中级水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中级方法（IdeS酶切抗体）需要更少的实际操作步骤和较少的示例处理，所有这些都意味着过程中出错的事情更少。我们的许多酶可以作为平台方法，同样的方法适用于绝大多数的抗体，这不是肽图的情况下，可能需要优化整个样品制备，LC分离，质谱设置和数据分析的每个不同的抗体分析。这些变化可能是很小的，但没有一种适用于所有肽图的方法。由于分析和数据分析的简单性，中级方法非常适合自动化和高通量的工作流程。肽图当然可以自动用于样品制备，但高通量肽图生成大量数据，仍然需要彻底分析。事实上，肽图谱是一个多步骤的过程，每一个步骤都可能破坏方法，并可能导致破坏蛋白质的人工制品，很难交叉训练给非专业人员。中级水平的方法很容易交叉训练，我们的方法在质量控制实验室中被成功地使用。肽图谱是一种用于修饰分析和氨基酸确认的方法，但一旦完成了这一工作，我相信使用中级分析可以成功地更有效地完成抗体样本的大部分工作。可精确定位特定的修饰。而无需肽图分析，可以较少的手动操作时间快速完成。
在Genovis，我们的策略是帮助客户进行中级（或亚基）分析，这是我们的工作，特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法，我们发现，与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比，中级方法具有优势。通过执行中级描述，您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息，具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时，很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进，可以更有效地分析更大的分子，但通过使用我们的SmartEnzymes，如IdeS，可以将抗体分解成更小的片段，这提高了这些实验可以执行的分辨率，因此，增加了鉴定修饰的信心。此外，你不*能够更好地识别修改，而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域，这是你在完整水平上无法做到的。来自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成。FabALACTICAIdeS蛋白酶蛋白组学
使用GlySERIAS 的连接子酶切可以通过分离连接的蛋白质结构域来帮助这种质量控制。湖南GlySERIASIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
样品制备的条件可能会在样品中诱发伪影，因此需要避免高温和碱性pH值进行质谱分析。如果可能的话，避免多个步骤并在一锅反应中进行消化和还原也可能是有益的。与IdeS不同，为了探索Genovis的GingisREX对离液剂和去液剂的稳定性和耐受性，在一系列试剂中测试了酶活性，并使用底物测定进行了评估。数据显示，GingisREX在6M时耐受尿素，吐温高达1%，但活性在0.1%时受到SDC的负面影响。该酶在 pH 值范围为 5.0 至 9.0 时显示出活性，在 pH 值为 6.5-8.0 之间。综上所述，GingisREX可用于一锅反应，以同时消化和变性6M尿素。与Genovis的IdeS不同，双特异性 T 细胞接合器 （BiTE） 分子是一种融合蛋白疗法，其中两个 scFv 融合，形成一个双特异性分子，其中一个 scFv 靶向细胞毒性 T 细胞，另一个靶向Ai症抗原。该蛋白质由四个蛋白质结构域组成，两个 scFv 均由 VL 和 VH 区域组成，总共由三个柔性 GS 连接子连接。这种蛋白质的大尺寸（54 kDa）可能对通过完整质谱法进行产品质量监测构成挑战，因为标准MS仪器可能无法提供蛋白质的单同位素分辨率。湖南GlySERIASIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶