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青海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

来源: 发布时间:2024年07月30日

在这里,Genovis分析了 C1 抑制剂——一种人血浆衍生的生物zhiliao药物,由 6 种 N-聚糖和多达 28 种 O-聚糖修饰,主要由唾液酸he心 1 结构组成。在不对这种高度异质的蛋白质进行任何预处理的情况下,反相LC-MS分析产生了无法详细解释的复杂质谱图。在天然条件下使用OmniGLYZOR Microspin色谱柱,可在3小时内有效去除所有O-聚糖。然而,蛋白质上仍残留着 1 到 3 个 N-聚糖。使用冻干的PNGase F和OmniGLYZOR试剂盒中包含的MS友好型RapiGest™ SF表面活性剂*,在变性条件下通过额外的去糖基化步骤去除这些不可接近的N-聚糖。观察到所有聚糖的完全去除,但分子上存在的少量he心 2 O-聚糖除外。水解O-聚糖的酶不会从变性中获益,这就是为什么OmniGLYZOR Microspin色谱柱只能在非变性条件下使用的原因。OglyZOR 来源于口腔链球菌,在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 227 kDa。青海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

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SialEXO 2-3 在天然条件下水解糖蛋白,在 pH 值范围为 7.0 至 9.0 时显示出活性。该酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。该酶具有 His 标签,分子量为 66 kDa。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高用于离心柱中糖蛋白去唾液酸化的固定化酶。Genovis的SialEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的SialEXO酶,用于糖蛋白的去唾液酸化,而不会被酶污染z终制剂。它水解天然糖蛋白上的唾液酸(α2-3、α2-6 和 α2-8)并释放出聚糖。效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。上海瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶疾病机理研究SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后,应用GalNAcEXO酶去除剩余的GalNAc残基。

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在抗体药物及核酸药物领域,倍笃生物产品线涵盖药物研发的全流程,主要用——RNA转染试剂、生物活性物质纯化分离用填料产品、ADC的payload抗体(如anti-DXD、anti-Eribulin、anti-MMAE等)、动物造模用阳性及阴性抗体、泊洛沙姆P 188 Bio、工艺杂质及外源污染物残留检测产品、抗体结构域分析蛋白酶、蛋白聚糖分析水解酶等,品牌有瑞典Genovis、德国BASF、美国QED、中国君研生物、中国金传生物、中国毫厘科技、中国再帆生物等。这些国产品牌都具有国内自研、自产能力,批次生产稳定可靠、品质可控,为行业发展提供更多国产选择。

为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性,将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时,OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc)。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品,以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化:O-糖基化生物制药(如依那西普)很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数,我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解,而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。生物制剂的表征和质量控制过程中确定电荷变体;

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我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可完全去除所有 N-和 O-糖,如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 (EPO) 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质,其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置,因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。PNGase F酶在大肠杆菌中表达,该重组基因来源于伊丽莎白金氏脑膜败血症。青海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

两种酶都含有 His 标签,酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。青海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

G0F 抗体在 30 分钟内:半乳糖的存在会影响zhiliao性抗体引发的效应功能,为了研究抗体的作用方式,可能需要彻底去除半乳糖残留物。Genovis的GalactEXO Immobilized 的 β1-4 半乳糖苷酶活性在曲妥珠单抗上使用 30 分钟孵育证明。genovis的GalactEXO Immobilized 由强大的 GalactEXO 酶组成,该酶固定在琼脂糖珠上,并以易于使用的微离心柱形式格式化。GalactEXO是β-半乳糖苷酶的混合物,可有效去除N-和O-糖基化蛋白上的半乳糖残基。使用FabRICATOR®将抗体消化成亚基,并使用LC-MS进行分析。使用 GalactEXO 冻干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的转变,但后者在z终制剂中没有留下酶。没有任何半乳糖基化结构表明半乳糖残基完全水解,因此LC-MS数据中任何剩余的次要峰都可以注释为亚基的糖化。没有任何半乳糖基化结构表明半乳糖残基完全水解,因此LC-MS数据中任何剩余的次要峰都可以注释为亚基的糖化。青海N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究