天津固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

C1抑制剂的去糖基化：在O-糖基化生物制药的生产过程中，由于he心GalNAc残基的加工不完全，可能会出现Tn抗原。这表现为具有 203 Da HexNAc 单位差异的重复质量位移。为了确认 Tn 抗原的存在，可以应用以下工作流程，此处在重度（26 个位点）O-糖基化 C1 抑制剂上演示。首先，使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖，使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能测试 ：依那西普是另一种具有挑战性的生物制药模型分子，携带 13 个 O-聚糖位点，其中平均 9 至 10 个位点被占用。亲和纯化微离心柱，SialEXO 冻干 200 单位，OpeRATOR 冻干 200 单位。天津固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

对Genovis的ImpaRATOR处理的样品的分析表明，ImpaRATOR很好地消化了所有三种底物并产生了相似的糖肽，但预期的聚糖种类不同。用ImpaRATOR处理的样品比其他样品含有更多的变异，因为每种肽都检测到多种聚糖结构。观察到的聚糖种类主要是单唾液酸化和二唾液酸化he心1结构，这与依那西普的预期一致。用ImpaRATOR或OpeRATOR消化的SialEXO预处理样品均产生具有裸核1结构的肽，但携带在ImpaRATOR消化样品中观察到的Tn抗原的肽T205-P207除外。依那西普用 SialEXO 和 GalactEXO 预处理，然后用 ImpaRATOR 消化，得到含有 Tn 抗原的肽。总之，这些数据证明了ImpaRATOR的高聚糖底物接受度。ImpaRATOR处理的依那西普显示出与相应的去唾液酸化OpeRATOR处理样品略有不同的消化模式。例如，OpeRATOR在两个O-糖基化氨基酸之间消化的效率比ImpaRATOR更有效。具有完整唾液酸或Tn抗原的依那西普被OpeRATOR消化得非常弱（数据未显示）。安徽PNGaseF去糖基化酶生物药物开发因此，其水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。

Genovis的SialEXO Immobilized是一种微离心柱，用于在室温下孵育30分钟后完全去除0.5mg天然糖蛋白上的唾液酸。为了研究依那西普的潜在电荷变体，开发了一种使用SialEXO固定化柱对糖蛋白进行去唾液酸化的一般工作流程。毛细管电泳通常用于在生物制剂的表征和质量控制过程中确定电荷变体。使用SialEXO Imfixedized对糖蛋白进行去唾液酸化，并使用ProteinSimple的Maurice在成像等电聚焦中进行分析。综合起来，该分析工作流程改进了糖蛋白的分离并实现了电荷异构体分析。依那西普，如果不首先去除唾液酸，将很难分析，但使用SialEXO固定化分离峰可以获得。

与PNGase F类似，Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖：糖基化往往是异质的，这使得对高度糖基化的生物zhiliao药物的分析具有挑战性。完整质量数的确认以及其他产品质量属性的表征受到不同糖型复杂性的阻碍，这就是为什么有效的聚糖去除工具简化了此类分析的原因。 虽然 N-聚糖包含一个共同的结构，并且可以通过 PNGase F 整体去除，但粘蛋白型 O-聚糖在结构上更加多样化，具有多个不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物，能够依次分解O-聚糖，以完全去除最常见的O-聚糖结构（二唾液酸和单唾液酸基he心1和Tn抗原）。SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后，应用GalNAcEXO酶去除剩余的GalNAc残基。

Genovis的SialEXO固定化用于复杂糖蛋白的去唾液酸化：在设置反应条件时，需要在所需的反应时间和完成反应所需的酶量之间进行权衡。较高的酶量可保证在更短的时间内完成周转，但会使下游分析复杂化。为了避免此类问题，我们以离心柱形式固定了活性SialEXO。这允许以更短的孵育时间孵育具有明显更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis测试了 SialEXO 冻干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制剂上的性能。这种糖蛋白是一种具有挑战性的底物，具有 6 个 N- 和多达 26 个 O-聚糖，由 α2,3 和 α2,6 连接的唾液酸修饰。对游离的N-聚糖的分析表明，SialEXO在溶液中完全脱唾液酸化，SialEXO固定化。用于水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游离寡糖上的α1-2、α1-3和α1-4-连接岩藻糖残基。天津固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

PNGase F是一种非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑战性，现有的O-糖释放化学方法不太适合下游分析。天津固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

genovis的FucosEXO在生理缓冲液和中性pH值中具有活性，使其与大多数样品相容。此外，FucosEXO活性不依赖于任何可能影响LC-MS分析的辅因子，如BSA。根据底物的性质，FucosEXO 可在 1 至 2 小时内水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 连接的岩藻糖残基，而对于非常复杂的样品可能需要更长的孵育时间。FucoseEXO也可固定在离心柱中，可快速方便地处理高达0.5mg的糖蛋白。使用离心柱形式，将糖蛋白样品与固定化的FucosEXO树脂一起孵育，然后在离心步骤中轻松收集消化的糖蛋白。天津固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究