在肠道微生态的商业运作方面，美国已经有两家纳斯达克上市公司专注于FMT诊疗，在欧洲也有多家企业和医疗机构专注于菌群移植（FMT）诊疗和肠道微生态产品的临床转化。肠道菌群移植技术在上海市第十人民医院和普陀区人民医院两个院区设有60余病床开展，而且现已满负荷。目前在我国17个省市的上百家医院开展过肠道微生态诊疗实践，其中尤以江浙沪地区医院开展的为频繁和规范，上海市医疗机构和生物技术公司是该技术主要的行业规范和标准制定单位。菌群制备需经过过滤、离心等步骤制成混悬液，新鲜菌群或冻存菌液的选择需结合临床场景与储存条件。湖南自体菌群移植适用人群
近年来，随着人口老龄化进程不断加快，人民慢性病疾病负担日益沉重，成为影响国家经济社会发展的重大公共卫生问题。例如，我国的constipation患者超过2亿；我国IBD患者近十年的发病人数达到前面十年的2.5倍，目前预计约有150万患者；我国消化道疾病特别是Colorectalcancer呈现快速增加的趋势，每年Colorectalcancer的发病人数达到37.6万人，且仍在以4.2%的速度快速增长；我国自闭症现存人群约有1000万；我国抑郁症人群近6000万；我国超重和肥胖患者达到3亿人，其中肥胖患者超过9000万。目前的研究发现肠道菌群与慢性疾病之间存在紧密联系，菌群移植可以通过人为调节人体肠道微生物达到缓解疾病的目的，极具临床应用前景。北京肠道菌群移植费用该技术需严格筛选供体菌群，确保无病原体污染，常用于难治性肠道疾病如溃疡性结肠炎的临床探索。
2021年4月23日首届泰山产业大集集中签约仪式在泰山国际会展中心一楼国际报告厅举行。泰安市医疗发展集团党委书记、理事长，泰安市中心医院党委书记、院长倪庆宾和上海沃本生物科技有限公司总经理许骋参加了签约仪式，双方就肠道微生态诊疗技术合作项目达成合作共识，签订了年产值1000万元的合作协议。总体合作目标：以泰安市中心医院临床资源为依托，结合上海沃本生物科技有限公司丰富的肠道微生态诊疗技术资源，以临床应用为导向，将“肠道微生态检测技术+生物组学大数据+创新诊疗”的深度融合作为突破口，双方共同建设涵盖肠道微生态前言检测、肠道微生态大数据和肠道微生态创新诊疗三大功能模块的肠道微生态诊疗共性技术中心，建立肠道微生态诊疗区域公共服务平台及示范应用基地。
菌群移植移植途径的选择：推荐在行FMT前评估消化道动力（1D）消化道动力影响菌液在消化道中的停留时间。另一方面，对于消化道动力差的患者，如一次性输注过多菌液，则极有可能引起或加重恶心、呕吐、腹胀、肚子疼等不良反应，故在行FMT前需评估消化道动力，并作为确定FMT路径与单次输注菌液体积的参考。例如，存在胃排空障碍的患者，不宜采用口服或鼻胃管路径；肠道动力缓慢的患者，应适当减少一次性输注菌液的量或减慢输注速度。消化道动力评估首先应询问病史，对于明显存在肠道动力紊乱的患者，可采用口服钡剂或小肠插管碘水造影法，既能动态观察消化道蠕动状况、又能观察消化道有无形态结构异常。不建议进行结肠传输试验，因为它耗时久、且不利于动态观察，意义不大。从传统粪菌移植到洗涤菌群移植，技术不断革新，安全性与疗效逐步提升。
粪菌移植可促进黑色素瘤患者对免疫诊疗的应答2021年以色列团队在《科学》上发表的报告显示，FMT能在早期临床试验中助力难治患者的免疫诊疗。试验中招募了10名PD-1单抗免疫诊疗无效的转移性黑色素瘤患者，粪菌捐赠者来自具有免疫诊疗缓解一年以上的黑色素瘤患者。在经过口服万古霉素和新霉素来破坏患者自身肠道菌群3天之后，临床医生给患者服用粪菌胶囊，随后注射纳武单抗（nivolumab），之后每两周进行粪菌移植和单抗注射的联合诊疗，直到90天为止。结果显示，共有3名患者对纳武单抗免疫诊疗产生积极反应，其中1名患者为完全缓解，2名患者为部分缓解，3名患者无进展生存期均超过6个月。令人惊喜的是，有2名患者的tumor在经历早期的变大之后，很快开始出现肉眼可见的萎缩。对肠道菌群严重紊乱患者，沃本菌群移植是改善病情的契机，有望解决一些疑难病症。上海研究菌群移植疗效
部分患者移植后可能出现短暂腹胀、排气增多等反应，通常可自行缓解，需关注是否存在严重并发症。湖南自体菌群移植适用人群
上海沃本生物科技有限公司创立于2020年4月，是一家专注于为慢性病疾患者提供基于肠道菌群移植技术的生物医药创新公司，公司位于上海浦东新区自由贸易试验区外高桥保税区。公司拥有具有自主知识产权的菌群移植技术全产业链服务，包括菌群移植相关的医疗器械研发、注册、生产与终端使用，菌群移植相关临床技术培训与标准化，与各级医疗机构合作共建肠道微生态诊疗中心的系统解决方案。我们的愿景：成为菌群干预方案领域的带领者。我们的使命：调节人体共生菌，开辟菌群移植应用新天地。主旨价值观：创新、质量、速度。湖南自体菌群移植适用人群