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m6A研究又有新手段了？赶紧来了解一下吧！栏目：研究动态发布时间：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一,Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究热点之一，目前主要的研究思路包括差异表达的write，reader和eraser基因分析；m6A抗体检测全转录组甲基化水平；分析m6A甲基化水平变化的靶基因和下游机制研究。而在7月25日的Cell上新发表了一篇介绍不使用m6A抗体的检测mRNAm6A水平的Resource文章，小编时间和大家分享一下。作者开发这一方法的前提是有研究报道了MazF能特异性的识别无修饰的ACA序列并发挥RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的个A发生m6A甲基化之后将无法被MazF所识别，如图一所示。图1MazFRNA酶作用示意图根据这一原理，作者将纯化后的mRNA进行MazF酶处理，然后再对打断的RNA进行逆转建库测序。对于无修饰的位点，ACA处被完全剪切，测序reads正好分布于该位点上下游而且比对至该处的上下游reads数是相同的.如图2所示。而甲基化位点的reads会包含上下游的序列。作者开发了MAZTER-MINE软件包专门进行分析（图3）。可以稳定的WB精髓与经验分享。湖北兔科研技术服务构建

静置25分钟后把酒精倒干，用吸水纸吸出多余的酒精，然后配压缩胶，同样的操作，关键是梳子要插得快，要小心梳子下产生气泡，然后静置30分钟。如果是当天跑胶，我会等上层胶凝2个小时再用，但要注意防干燥缩水，可以在一个小时的时候沿着梳子上缘加点电泳液。所以我一般提前一晚制胶，泡于纯水或者电泳液里置于4度冰箱暂存。三、蛋白电泳1、上样前准备把胶组装到电泳芯上，注意密闭性(否则漏液)，如果内槽漏液就不是匀强电场了，条带可能就不是一条直线。然后内槽倒满电泳液，拔梳子，这一步要小心，梳子要两边一起缓缓往上拔出，然后观察泳道内有无脱落的胶粒或者胶丝，有的话用1毫升注射器吸出。然后从冰箱取出蛋白样品，解冻。准备振荡器。2、上样和电泳注意，上样后蛋白会开始慢慢在胶中弥散，所以上样越快越好。我习惯先上蛋白Marker,再上蛋白样品，蛋白上样前确保样品完全解冻和充分振荡(推荐使用振荡器振荡)，吸的时候没有拉丝即可，建议上样分钟把样品从冰上取出来，不然样品中SDS可能会结晶析出，从而影响电泳效果。上层胶80V25分钟，下层胶120V65分钟。四、转膜1、转膜前准备我会在电泳结束0分钟准备，把转膜液配好置于4度冰箱预冷，然后裁膜，准备转膜装置。贵州模式科研技术服务服务RNA提取过程中试剂的作用是什么？

用途基因功能研究、免/杀伤/增殖等、抗体活性筛选（细胞水平的结合和阻断）、CAR分子的杀伤活性评价。材料与仪器（以慢pMSCV载体为例）包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV质粒、带有eGFP-Tag的pMSCV空载质粒、GAG质粒、VSV质粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T细胞、opti-MEM、DMEM、FBS、双抗、μm的滤膜、荧光显微镜等。步骤1、基因的构建1)根据目的基因mRNA编码区设计引物，分别在引物两端加入酶切位点EcoRI和BglII。2)从细胞中提取目的基因mRNA，然后逆转录成cDNA，然后从cDNA里面用引物把目的基因的CDS区扩增出来。PCR扩增出带有酶切位点的目的基因编码区序列，连接至pMD19-T载体后转化至感受态DH5α，分别进行菌落PCR鉴定和酶切鉴定。3)使用EcoRI和BglII双酶切下目的基因序列，电泳割胶回收纯化，连接到pMSCV-eGFP载体。再次转化到感受态DH5α，菌落PCR鉴定和酶切鉴定成功后，送至公司测序、鉴定。4)鉴定成功后，将质粒转化至感受态DH5α中，并进行无内质粒抽提。GAG质粒和VSV质粒同样可以转化至感受态DH5α中，并进行无内质粒抽提。质粒抽提后冷冻于-20℃保存。2、慢包装1)使用DMEM完全培养基培养6cm皿HEK293T至汇合度为70~80%。

原理HE染色主要使用苏木精和伊红这两种染液，其中苏木精碱性染液为蓝色，可以将组织的酸性结构染成蓝紫色（细胞核呈现蓝色；软骨基质、钙盐颗粒呈深蓝；粘液呈灰蓝）；伊红是一种化学合成的酸性染料，在水中解离成带负电荷的阴离子，易于蛋白质氨基中的正电荷结合使细胞浆染色。细胞浆、肌肉、结缔组织、嗜伊红颗粒等被染成不同程度的红色或粉红色。材料与仪器小鼠、固定液、酒精、二甲苯、石蜡、蜂蜡苏木精染液、伊红酒精溶液、盐酸酒精溶液甘油蛋白粘片剂、中性树胶石蜡包埋机、切片机、恒温箱、蜡杯酒精灯、解剖剪、培养皿、镊子、单面刀片染色缸、盖玻片、载玻片、玻片盘、显微镜温度计、水浴锅步骤一、制作卵巢石蜡切片1、取材小鼠腹腔注射戊巴比妥钠（50mg/kg）进行麻醉，颈椎脱臼法处死小鼠，取出双侧卵巢。取下所需组织，切成一小块3~4mm厚。2、固定、洗涤、脱水（1）将切好的卵巢组织用生理盐水洗一下，使用中性福尔马林固定液固定30~50min。后用流水冲洗3次，每次5min。（2）卵巢组织依次经70%、80%、90%乙醇溶液脱水，各30min。（3）再放入95%、100%乙醇溶液各2次，每次20min。3、透明、透蜡（1）使用纯酒精、二甲苯等量混合液处理组织15min。通过不同分组之间的细胞对于划痕区修复能力的不同，可以判断各组细胞的迁移与修复能力的差别。

m6A修饰图谱构建及作用机制：通过m6A甲基化测序（MeRIP-Seq,miCLIP）构建疾病细胞模型或者发病组织的m6A修饰谱，分析m6A的motif,peaks数量及分布，Peak关联基因的特征，联合RNA-seq研究m6A甲基化与表达的关系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)为研究ALKBH5的m6A作用机制，作者利用芯片和m6A-seq筛选到胶质瘤增殖相关的FOXM1，通过qPCR、WB、免疫荧光、核质分离WB/qPCR、RIP和MeRIP等实验证明ALKBH5通过去甲基化调节FOXM1在GSCs中的表达。为研究ALKBH5对FOXM1的作用是否受其他因子的调节，作者研究了FOXM1的邻近基因，发现lncRNAFOXM1-AS与FOXM1序列互补，且共表达、共定位，进一步通过RIP,RNApulldown等实验证明lncRNAFOXM1-AS促进ALKBH5和FOXM1初级转录本的相互作用。通过细胞实验进一步验证ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下维持FOXM1的表达和细胞增殖，从而维持GSCs的干性。图3ALKBH5敲除细胞中m6A修饰的特征和基因表达的变化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表观遗传改变极大地促进了人类症的发生。传统的表观遗传研究主要集中在DNA甲基化，组蛋白修饰和染色质重构。近。动物疾病模型是一种用于研究人类疾病的重要工具。贵州模式科研技术服务服务

EdU细胞增殖检测是一种新型的细胞增殖检测方法。湖北兔科研技术服务构建

脓毒症动物模型必须具备以下基本要素：有脓毒症典型的高排低阻血流动力学表现和高代谢状态；伴发多个功能障碍；有较高的自然死亡率，根据脓毒症的转归，要求动物模型的自然死亡率达到50%～70%；脓毒症是严重引起机体的炎症反应过度造成的自身损伤，不是细菌和内对机体的直接损伤，故出现功能障碍及动物死亡距脓毒症模型制备应有一定的时间间距。一般在制模后6～12h后发生的功能障碍或死亡属全身炎症反应所致。实验动物的选择在制作动物模型时多选用雄性小鼠，因为雌性小鼠较雄性小鼠更能耐受脓毒症和失血性休克，且进入发期的雌性小鼠性水平变化很大，而雄性小鼠在脓毒症时更易于发生免疫抑制。为什么选择CLP模型？盲肠结扎穿孔模型（CLP）模型是接近于人类脓毒症机制的模型，被称为脓毒症模型的“金标准”。CLP技术在20世纪70年代被建立。CLP模型非常适宜用于防治脓毒症或脓毒性休克新药的临床前观察造模方法CLP脓毒症模型的建立主要分为两个阶段：盲肠远端结扎和盲肠穿刺。首先是手术引发的结扎部位组织变性坏死引起局部炎症反应，其次是穿孔后使粪便内容物漏入腹膜引起多菌性细菌性腹膜炎，进而诱发全身性炎症反应。湖北兔科研技术服务构建