克劳氏芽孢杆菌(Bacillus clausii)是芽孢杆菌属中的“耐碱”,1915年由意大利克劳氏从碱性土壤中分离,菌体杆状、周生鞭毛,可在 pH 8–10.5、盐 0–12 % 的条件下旺盛生长,芽孢能耐受 100 ℃ 沸水 30 min,是研究极端碱适应的模式菌之一。一、耐碱机制基因组编码多拷贝 Na⁺/H⁺ 逆向转运蛋白(nhaC、mnh)与碳酸酐酶,可将胞内多余 Na⁺ 泵出并维持 pH 稳态;细胞壁肽聚糖富含 meso-二氨基庚二酸,膜脂分支化程度高,为高温高碱酶的高效表达提供稳定平台。二、工业酶宝库其耐碱蛋白酶在 pH 11、40 ℃ 仍保持 90 % 活性,已用于无磷洗涤剂,血渍、奶渍去污力提升 30 %;耐碱淀粉酶更适 pH 9、90 ℃,可在纺织退浆中省略中和步骤,节能 15 %;耐碱木聚糖酶用于纸浆漂白,氯用量减少 30 %,降低可吸附有机卤化物(AOX)排放。三、农业与环境菌株 SIN 可产 IAA 15 mg·L⁻¹ 并溶磷 2.6 mg·L⁻¹,使玉米根系增 28 %,吸磷量提 18 %;与秸秆复配堆肥,24 h 堆温升至 65 ℃,纤维素降解率提高 30 %,堆肥周期缩短 6 d。耐碱特性使其在 pH 9 的苏打盐碱土中仍能定殖,水稻产量增加 10 %。奇异水螺菌还被用于生物防治,其产生的物质可以抑制一些植物病原菌的生长,从而减少农药的使用。华丽黄链霉菌
乳酸铁营养琼脂(Lactose Iron Nutrient Agar)是一种兼具选择性、鉴别性与营养性的复合培养基,常用于食品、水质及临床标本中革兰阴性肠道菌的快速分离与初步鉴定。其关键原理在于“双指示”设计:乳糖作为可发酵碳源,与铁盐共同构成判别系统——能发酵乳糖的菌株产酸,使酚红指示剂由红变黄;若同时产气,则可在培养基内形成气泡或裂缝。而铁离子的加入,让具备硫化氢(H₂S)生成酶的细菌(如某些变形杆菌、沙门氏菌)将硫代硫酸钠还原,与Fe²⁺结合生成黑色FeS沉淀,菌落中心呈现特征性黑心,实现“一眼辨菌”。配方上,乳酸铁营养琼脂在营养琼脂基础上添加1%乳糖、0.02%硫代硫酸钠与0.02%柠檬酸铁铵,pH调至7.4±0.2,既保证肠杆菌科的基本营养需求,又通过高糖与铁盐抑制部分非目标菌的过度生长。倾注平板后呈淡红色半透明,若室温存放出现泛黄,说明培养基已酸化,需弃用。接种时,多采用分区划线,35℃培养18–24小时即可读取结果:乳糖发酵阳性菌(如大肠埃希菌)形成黄色、边缘整齐的大菌落;乳糖阴性菌(如志贺菌)则保持红色;若菌落中心发黑,则提示H₂S阳性,需进一步做血清学或质谱确认。白色异库茨涅尔氏菌小小沙福芽孢杆菌,用微米之躯守护绿色丰收,让农药瓶少一个,饭碗多一粒。

德氏乳杆菌德氏亚种(Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii)是乳酸菌家族中更早被分离命名的“元老”之一,1901年即进入科学视野。菌体短杆、无芽孢、不运动,专性发酵葡萄糖产乳酸,更适生长温度42~45℃,可在pH 3.5的酸环境中存活,耐高温却畏冷,4℃即停止繁殖。基因组只1.8 Mb,代谢途径精简,却拥有完整的乳酸脱氢酶与寡肽转运系统,使其在蛋白质丰富的基质中快速产酸,抑制菌。工业上,它是酸奶、瑞士奶酪与保加利亚传统发酵乳的关键菌种,与嗜热链球菌协同可将牛乳在3小时内酸化至pH 4.2,形成细腻凝乳与特征性乙醛风味;同时分泌胞外多糖,赋予产品顺滑口感并延缓后酸化。近年研究还发现,其表面蛋白SlpA能黏附肠道上皮,诱导IL-10分泌,缓解小鼠结肠炎;热灭活菌体亦可通过启动树突细胞TLR2信号,增强肠道IgA应答,兼具益生与免疫调节潜力。随着合成生物学兴起,德氏乳杆菌德氏亚种被工程化改造为“活药工厂”,可在肠道内持续释放胰岛素样肽或白细胞介素,为糖尿病与炎症性肠病提供新型微生态治疗方案。
绿色绿芽菌(Blastochloris viridis)是一株绿色、能出芽的光合细菌,隶属α-变形菌纲芽生绿菌属。菌体圆形至卵圆,具极生鞭毛,可活跃游动;革兰氏阴性,无芽孢,不形成芽孢链,通过不对称出芽繁殖,是光合菌中少见的“芽殖型”。它的培养物呈橄榄绿至翠绿,源于细菌叶绿素b与类胡萝卜素的组合,吸收波段集中在700-900 nm近红外区,可在弱光或近红外环境中进行不产氧光合,为光能异养生长提供优势。更适生长温度30℃,pH 6.8-7.5,盐度0-6%,兼性微好氧,黑暗条件下也能缓慢呼吸增殖,适应淡水到河口多种生境。绿色绿芽菌的光合内膜为囊泡状,含Q-8、Q-10、MK-7、MK-9等醌类,G+C mol% 66-71,系统发育与红游动菌属更接近。其反应中心结构与电子传递链已被解析,是研究光能转化和人工光合器件的模型生物。应用方面,菌株ATCC 19567常用于教学与科研;因其能利用低级脂肪酸和多种有机酸,也被探索用于高浓度有机废水处理,可在光照厌氧反应器中同步去除COD并回收单细胞蛋白,为“光合-净水-资源”一体化提供新思路。随着合成生物学发展,绿色绿芽菌的细菌叶绿素b合成基因簇已被克隆,为构建近红外驱动细胞工厂奠定了遗传基础。橙色隐孢囊菌是一种属于隐孢囊菌属,形态特征:革兰氏阳性,菌丝分枝,基丝不断裂。孢囊孢子可游动 。

巴基斯坦赖氨酸芽孢杆菌(Lysinibacillus pakistanensis)是2009年从巴基斯坦干旱区大豆根际分离的新种,因肽聚糖含meso-二氨基庚二酸而非赖氨酸,在属内独树一帜。菌体革兰氏阳性、具周生鞭毛,可形成椭圆芽孢,能在10–28℃、pH6.5–9.0及0–6%NaCl范围内生长,并耐受150mM硼酸,被视为“中度耐硼”的旱地先锋。在抗逆机制上,该菌细胞膜以二磷脂酰甘油、磷酸乙醇胺为主,脂肪酸iso-C18:0占30%,赋予其高膜稳定性;基因组G+C含量37%,携带多重外排泵与渗透调节基因,可在干旱、盐碱环境中维持胞内水平衡。功能层面,巴基斯坦赖氨酸芽孢杆菌表现出“促生-抗病-解”三合一特性。实验室条件下,其IAA产量达118mg/L,明显高于同属菌株,可刺激小麦根长增加35%,干重提高28%;菌液处理后,花生根结线虫侵染率下降42%,对南方根结线虫卵孵化抑制率超60%,为线虫绿色防控提供新选择。此外,该菌对革兰氏阴性植物病原菌具有明显抑菌圈,代谢产物中的酶抑制剂可干扰细菌双功能酶系统,相关菌机制仍在持续解析。它属于芽孢杆菌属,具有形成孢子的能力,这使得它能够在恶劣的环境条件下保持稳定。酿脓链球菌
作为植物病原菌,野油菜黄单胞菌对多种常用抗生物质具有耐药性,这给医学方面带来了挑战。华丽黄链霉菌
嗜盐盐渍微菌(Halomonas sp.)是一类生活在海水、盐湖、盐碱土壤等高盐环境中的革兰氏阴性杆菌,更适 NaCl 浓度 3 %,但可在 1 %–25 % 盐度范围内存活,堪称“轻-中嗜盐标兵”。菌落乳白色、边缘整齐,短杆状细胞具单极鞭毛,能形成胞外多糖,既吸附 Na⁺ 缓解渗透胁迫,又便于自身在固体表面形成生物膜。其耐盐策略采用“相容溶质”模式:细胞内大量积累四氢嘧啶(ectoine)和脯氨酸,不干扰酶活;膜脂含磺化糖蛋白 S 层,负电荷屏蔽高阳离子,维持膜结构稳定。因此,在盐度突变、重金属并存时仍能快速繁殖。环境工程上,Halomonas sp. 是“高盐脱氮王”。新疆盐湖菌株 5505 在 8 % NaCl 下对氨氮、硝态氮、亚硝态氮去除率分别达 100 %、94 % 和 74 %,氮素主要通过同化作用进入菌体,污泥产量低,为高盐废水生物净化提供了高效菌种资源。另有菌株 PH4-5 可在 3 %–12 % 盐度下降解苯酚,68 h 去除率 > 90 %,为含盐含酚工业废水处理带来新思路。农业方面,Halomonas 能溶解钾长石、释放钾,并分泌 IAA 促进作物根系在盐碱地生长;与藻共生时,还可利用微藻释放的甘油作碳源,实现“菌-藻”联合修复高盐盐碱土。华丽黄链霉菌