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广州透射电子显微镜技术应用

来源: 发布时间:2023年09月21日

冷冻电镜技术解析结构主要风险在:A.样品很不稳定,样品寄送过来的时候,已经降解或者聚集,无法进行后续处理;B.样品在冷冻制样的过程中,可能会被冻碎,从而无法进行后续处理;C.样品纯度可能很好,但是均一度很差,从而难以获得样品的高分辨结构;D.我们关心的区域可能在整个复合体中有很强的柔性,从而经过二维或者三维平均后,我们关心区域的分辨率会比较差甚至看不见,达不到我们的预期;E.一些配体,比如药物前体分子,分子量太小,不一定能在电镜的密度图中观测到;F.对于合适的样品,我们冷冻制样需要优化的参数有很多,包括样品浓度的优化,blottime的优化,温度的优化,grid规格(铜网或者金网)的优化等一系列条件的优化。因此冷冻电镜制样需要丰富的经验和充足的机时支持,不同的实验者,成功率可能差别很大。冷冻电镜技术之冷冻蚀刻电子显微镜优点:能耐受电子束轰击和长期保存。广州透射电子显微镜技术应用

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冷冻电镜技术原理之单颗粒技术:对分散分布的生物大分子分别成像,基于分子结构同一性的假设,对多个图像进行统计分析,并通过对正、加和平均等图像操作手段提高信噪比,进一步确认二维图像之间的空间投影关系后经过三维重构获得生物大分子的三维结构方法。其适合的样品分子量范围为80~50MD,Zgao分辨率约0.3nm。利用单颗粒技术获得三维重构的方法主要包括等价线方法、随机圆锥重构法、随机初始模型迭代收敛重构等方法,其基本目标是获得二维图像之间正确的空间投影关系,从而进行三维重构。韶关透射电镜技术平台冷冻电镜技术,是一种重要的结构生物学研究方法。

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单颗粒冷冻电镜技术样品的筛选和数据采集:在开始高分辨数据采集前,可以利用冷冻电镜先对样品质量进行评估,包括但不限于蛋白浓度、稳定性和分布,冰层厚度、质量和载网各处的均一性等的检查。用户可以在120kV电镜或200kV电镜上进行此筛样过程。待到样品通过筛选,用户可以利用300kV或200kV电镜采集更大的数据量来帮助开展2D和3D分析。200kV-TalosArctica透射电镜配备了直接电子探测相机FalconIII,在样品质量较高时,较高可以获得<3Å的数据。目前的300kV-TitianKrios透射电镜有两套,其中一台配备了目前行业前列的K3直接电子探测相机,另一台配备有K2相机和能量过滤器,两套电镜均能够进行全自动、长时间无人照看的数据收集操作,可实现样品的大规模数据采集,并获得极高分辨率的结构信息。收集得到数以万计的单颗粒物照片后,用户可以使用平台集群已安装的常用三维重构计算软件以及相关生物软件对数据集进行计算处理。

低温透射电镜技术的应用:胶束体系对于浓度、pH、添加剂种类等液相环境条件的变化非常敏感,如果是干燥状态其结构与有液相完全不同,因此必须用低温透射电镜表征其结构。通常情况下,胶束有球状、囊泡状、棒状、层状、六角束状、洋葱状、蠕虫状等多种形状,应用低温透射电镜技术,囊泡、胶束的结构可以被原位的真实呈现出来,可清晰地观察到囊泡的完整性、分布、大小、融合等情况,而在普通电镜条件下,干燥后的囊泡的形状、结构很容易发生变化。同样,低温透射电镜也能够有效保持聚合物在液相的形态,可清晰地观察到聚合物的形态及聚集状态。目前,低温透射电镜在生物大分子的成像尤其是蛋白结构的解析方面已经取得了诸多突破的成果,相信在化学分子材料领域也会展现很好的应用前景。冷冻电镜技术的研究,主要是冷冻成像和蛋白快速冷冻技术。

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冷冻电镜技术揭示生物分子细节:在透射电子显微镜下,高能电子束穿透每一个分子,如同X光穿过人的身体一样,可以拍摄到分子的形貌和它内部的结构信息。科学家们利用计算机将样本里的每一个分子提取出来,把相似的分子予以归类,然后叠加、平均获得其内部结构更为精细的图像,由此得到分子不同方向的二维结构,较后经过计算机三维重构算法,可以得到分子的三维模型。这一过程被称为冷冻电镜三维重构解析。冷冻电镜技术的发展,使得现在的人类可以对细胞内的生命活动有更多了解。未来,科学家将借助冷冻电镜技术继续对复杂生命体的解读。冷冻电镜技术也正在成为助力医药研发的有力手段。杭州冷冻透射电子显微镜技术平台

冷冻电镜技术之冷冻透射电镜优点:样品台稳定;第四是全自动,自动换液氮,自动换样品,自动维持清洁。广州透射电子显微镜技术应用

冷冻电镜技术解析结构的一般流程是怎样的?对样品的要求是什么?冷冻电镜解析蛋白结构一般流程为:蛋白表达纯化;负染样品准备:约2小时完成;负染样品的数据收集:约8小时完成;冷冻样品的准备:约4小时完成;冷冻样品的数据收集:48-120小时完成。三维结构重建。冷冻电镜解析蛋白结构对蛋白质的要求:分子量:一般需要样品的分子量在200kD以上。缓冲液:缓冲液中不能含有多糖,DMSO,甘油等有机物质,这些会降低样品的衬度,难以获得高分辨的三维结构。一般而言,缓冲液为20mMHepes,150mMNaCl。浓度:一般而言,可溶性蛋白浓度应在1mg/ml左右,膜蛋白应保证浓度在5mg/ml左右。体积:20ul足够(前提是需要蛋白浓度达标,做一个样品3ul左右)。均一性:分子筛行为表现为单一的峰,均一性大于90%。广州透射电子显微镜技术应用