蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。但要在亲和步骤中捕获 Fc 片段,您需要另一种填料。海南GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切

与IdeS不同,Genovis的GlySERIAS是一种独特的酶,可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子,例如Gly4Ser和GlyxSery(GS)以及聚甘氨酸(G)接头。该酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域,以促进表征并增加对这些分子的理解。融合蛋白的中级分析既可以降低整体样品的复杂性,又可以对翻译后修饰进行结构域特异性鉴定和监测。为了改善连接子的去除,Genovis建议使用GlySERIASImmobilized。对于连接子表征,我们推荐GlySERIAS冻干。具有柔性接头的独特酶消化融合蛋白;中级方法可降低融合蛋白表征的复杂性;复杂融合蛋白的可靠且可重复的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和丝氨酸残基的重复序列组成的柔性连接子。该酶在天然反应条件下具有活性,能够对复杂的融合蛋白进行中级表征。连接子区域同时在多个位点被消化,导致先前连接的组分分离。活性发生在pH7.6下,孵育时间可以根据所需的产物而变化。GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的,在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为18kDa。海南IdeS蛋白酶蛋白组学使用FabRICATOR(IdeS)的抗体消化的简单性、速度和可重复性也意味着这种酶可以被用于质量控制应用。

其他基于 IgG 的生物制药需要仔细表征和监测关键质量属性,例如氧化、糖基化和其他翻译后修饰。与抗体的克隆选择、工艺开发和稳定性研究相关的大量样品通常通过液相色谱质谱 (LC-MS) 进行分析。然而,在LC-MS之前进行足够规模的样品制备通常具有挑战性。为了解决样品制备的挑战,Genovis将半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR(IdeS)固定在磁性琼脂糖珠上,现在称为FabRICATOR MagIC。FabRICATOR固定在磁珠上,可同时快速自动消化多种抗体,促进中级表征工作流程。Genovis的FabRICATOR MagIC 如何以较少的用户交互减少实验和操作时间,降低样品处理错误的风险,同时提高通量。
Genovis提供冻干和固定化的FabRICATOR(IdeS),为客户提供了许多选择,以满足他们的需求。 冻干形式用于高度灵活的方法开发的目的,并随时准备使用,只需重组和添加到IgG样本。 冻干酶的灵活性也意味着它可以应用于更高的通量和自动化的工作流程。 Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶,在随时可用的旋转柱中,这可以极大限度地减少在样品中残留的酶,这可能是有利的。 对于更多的制备应用,我们提供FabRICATOR Fab2试剂盒,这是IgG片段生成和纯化的强大工具。 这包括FabRICATOR固定化柱和CaptureSelect Fc纯化柱,用于亚基的亲和纯化。 由于FabRICATOR在非还原条件下是活性的,F(ab’)2片段保留其链间和链内二硫键,如果片段想用于结合研究,这一点尤为重要,因为结合效率和免疫反应性将被保留。FabRICATOR(IdeS)不需要还原条件来获得比较好的活性。

与IdeS不同。Genovis的IgASAPSub1是一种IgA1特异性酶,可在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。IgASAPSub1可水解分泌物和血清IgA1。消化在1小时内完成,并且由于酶的特异性,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。该酶在pH值6.5至8.0下具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可发挥活性。活性是在37°C下,但也可以在室温下使用增加孵育时间进行消化。IgASAPSub1是从口腔链球菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为148kDa。IgASAPSub1冻干剂以冻干粉的形式提供,装在1000个单位的小瓶中,用于消化1mgIgA1。生成完整的 Fab片段或从依那西普上的融合TNFR结构域中分离 Fc。青海FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学
可使用FabULOUS 和 FabULOUS Fab 试剂盒可用于制备 Fab 片段。海南GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切
在Genovis,我们的策略是帮助客户进行中级(或亚基)分析,这是我们的工作,特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法,我们发现,与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比,中级方法具有优势。通过执行中级描述,您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息,具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时,很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进,可以更有效地分析更大的分子,但通过使用我们的SmartEnzymes,如IdeS,可以将抗体分解成更小的片段,这提高了这些实验可以执行的分辨率,因此,增加了鉴定修饰的信心。此外,你不仅能够更好地识别修改,而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域,这是你在完整水平上无法做到的。海南GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切