2015年，江苏省在全国率先将菌群移植（FMT）纳入医疗服务收费项目。随后，通过本项目团队的努力，山东、河北、云南、广东等省份也将FMT纳入临床收费项目，推动了FMT在国内的发展。2020年8月20日，上海市将粪菌移植纳入医疗新技术目录，是我国早期个将FMT正式纳入临床医疗服务的直辖市。菌群移植的临床试验结果显示，对于部分可不住院的患者可以通过提供肠道菌群胶囊方式为患者进行菌群移植服务，根据中华胃肠外科杂志刊登的共识提示对于部分疾病使用菌群胶囊效果与住院诊疗无统计学差异。儿童患者可通过调整剂量进行菌群移植，对肠炎、自闭症等疾病有一定干预效果。安徽腹泻使用菌群移植收费码
阿尔茨海默病难治难医？菌群移植带来新曙光！《2019年全球卫生估计报告》显示，在过去20年，阿尔茨海默病（AD）和其他形式的痴呆症已经成为全球占据重要死因之一。截至2019年，我国有超过1千万名AD患者，是全球AD患者数量很多的国家，占世界AD患者总人口的1/4，而且这个数字还在随人口老龄化不断攀升。近年来，一些临床和实验证据都提示肠道菌群在神经退行性疾病的发生及发展中扮演着重要角色，肠道菌群移植（FMT）有望成为预防或诊疗AD的良方.河北医院菌群移植**共识部分患者移植后可能出现短暂腹胀、排气增多等反应，通常可自行缓解，需关注是否存在严重并发症。
近年来，随着我国人口老龄化进程不断加快，慢性疾病负担日益沉重，成为影响国家经济社会发展的重大公共卫生问题。慢病与肠道菌群之间的关联研究已取得大量重大科学成果，而作为肠道微生态诊疗的重要临床技术肠道菌群移植是将健康人粪便中的功能菌群通过一定方式移植到患者肠内，以调节肠道菌群失衡，重建具有正常功能的肠道微生态系统，达到对肠内肠外疾病的诊疗或辅助诊疗作用。肠道菌群移植菌液的制备已成为当前临床应用和转化的热点。
益生菌有助于促进接受者的健康，而益生元是益生菌的主要食物来源21。Bonfili等人的一项研究使用了乳杆菌（Lactobacillusacidophilus、L.brevis、L、L.paracasei、L.plantarum）和双歧杆菌（Bifidobacteriumbreve、B.longum、B.infantis）的混合物（称为SLAB51）处理AD转基因模型小鼠。四个月后，在AD小鼠中观察到双歧杆菌的增加和弯曲菌属的减少。在服用SLAB51的AD小鼠中，还观察到了肠道菌群的代谢物，如可改善认知功能的SCFA含量的改变。Ho等人的一项研究报道了肠道菌群在一定程度上会通过增加特定SCFA的产生，来抑制Aβ可溶性聚集体形成，从而预防AD。在一项研究中，Kobayashi等人表明B.breveA1的摄入降低了海马神经元中的炎症和免疫反应基因的表达。在近期的一项研究中，Abraham等人表明与未服用益生菌的小鼠相比，益生菌足以改善AD小鼠的认知能力。除了饮食干预和益生菌外，FMT是调节肠道菌群的很有效的诊疗选择。这种方法已显示出对各种神经系统疾病，如AD、帕金森病（PD）和多发性硬化症（MS）的改善。移植途径包括口服胶囊、结肠镜输注等，无创的胶囊方式因便捷性逐渐成为主流选择。
目前中国开展50余项（含香港6项，中国台湾2项）菌群移植临床研究，合计完成了总数近万例次的移植，但远远未达到市场及临床需求。上海市第十人民医院团队2014-2018年的随访数据显示，患者接受菌群移植诊疗后3个月，1年，3年后的临床改善率和改善率分别为：constipati41.3%(560/1356），35.2%(320/909），31.4%（69/220）和70.3%(953/1356)，63%（573/909），60.5%（133/220）；炎症性肠病33.1%(58/175)，29.9%（35/117），24.5%（12/49）和64.5%(113/175)，57.3%（67/117），57.1%（28/49）；慢性腹泻87.8%(130/148)，81.8%（81/99），78.3%（36/46）和95.9%（142/148），88.9%（88/99），82.6%（38/46）；放射性肠炎61.4%(78/127)，56.5%(48/85)，47.6%(20/42)和77.9%(99/127)、71.8%(61/85)，61.9%(26/42)；肠易激综合征53.8%(64/119)，45.0%(36/80)，40.0%(6/15)和74.8%（89/119)，71.3%(57/80)，66.7%(10/15)；自闭症23.5%(20/85)，22.8%(13/57)，20.0%(5/25)和78.8%(67/85)，71.9%(41/57)，60.0%(15/25)；临床中，菌群移植多用于难治性肠道疾病如溃疡性结肠炎，也在探索对肥胖、抑郁症等肠外疾病的干预潜力。山东直肠菌群移植安全性
移植后建议搭配膳食纤维饮食，帮助新菌群定植，多数患者 1-2 周内可见症状改善。安徽腹泻使用菌群移植收费码
近年来，随着人口老龄化进程不断加快，人民慢性病疾病负担日益沉重，成为影响国家经济社会发展的重大公共卫生问题。例如，我国的constipation患者超过2亿；我国IBD患者近十年的发病人数达到前面十年的2.5倍，目前预计约有150万患者；我国消化道疾病特别是Colorectalcancer呈现快速增加的趋势，每年Colorectalcancer的发病人数达到37.6万人，且仍在以4.2%的速度快速增长；我国自闭症现存人群约有1000万；近年来，随着人口老龄化进程不断加快，人民慢性病疾病负担日益沉重，成为影响国家经济社会发展的重大公共卫生问题。例如，我国的constipation患者超过2亿；我国IBD患者近十年的发病人数达到前面十年的2.5倍，目前预计约有150万患者；我国消化道疾病特别是Colorectalcancer呈现快速增加的趋势，每年Colorectalcancer的发病人数达到37.6万人，且仍在以4.2%的速度快速增长；我国自闭症现存人群约有1000万；我国抑郁症人群近6000万；我国超重和肥胖患者达到3亿人，其中肥胖患者超过9000万。目前的研究发现肠道菌群与慢性疾病之间存在紧密联系，菌群移植可以通过人为调节人体肠道微生物达到缓解疾病的目的，极具临床应用前景。安徽腹泻使用菌群移植收费码