核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸内切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修复酶,但它们之间存在一些关键的区别:1.**活性类型**:-**核酸内切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以释放受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,产生一个脱嘌呤(Apurinic,AP)位点;AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。-**核酸内切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能够切割DNA磷二酯骨架在AP位点处,但不具备δ裂解酶(δ-lyase)活性。2.**识别和切除的受损碱基**:-**核酸内切酶VIII**:可以识别并切除包括尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲在内的多种受损碱基。-**核酸内切酶III**:主要识别和切除氧化性损伤的嘌呤碱基,如8-氧鸟嘌呤。3.**裂解酶活性**:-**核酸内切酶VIII**:具有β和δ裂解酶活性,而**核酸内切酶III**具有β裂解酶活性。这些区别决定了它们在DNA损伤修复中的作用和应用范围。
Cre重组酶在基因编辑中的操作主要涉及以下几个步骤:1.**识别与结合**:-Cre重组酶首先识别并分别结合两个LoxP序列的两个反向重复序列,形成一个二聚体。2.**四聚体形成**:-两个二聚体互相靠近,形成由四个Cre分子与两个LoxP位点结合形成的四聚体复合物。3.**DNA切割与交换**:-Cre重组酶在每个LoxP位点的间隔序列中引导单链切割,产生带有3’端羟基的断裂。每个LoxP位点的两个单链分别被切割。切割产生的自由3’端与对侧的3’端进行交换和重连,形成Holliday交叉结构。4.**分子重组与解旋**:-Holliday交叉结构通过Cre酶的作用被解旋并重组,形成新的重组产物。这个过程导致两个LoxP位点之间的DNA序列被删除、反转或易位,具体效果取决于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**条件性基因编辑**:-通过建立特异性Cre小鼠,该小鼠中的Cre重组酶由特定启动子驱动,可在特定细胞或组织或全身表达Cre重组酶。与带有Lox位点的Flox小鼠杂交,子代中可以获得既带有Cre又带有Flox基因的小鼠,实现条件性基因打靶(表达或敲除靶基因)。Recombinant Human CA9/Carbonic Anhydrase IX (His-Avi Tag)在这个过程中,E1使用ATP的能量,在自身的活性位点的半胱氨酸残基与泛素C末端的甘氨酸残基形成硫酯键。
在PCR实验中,防止非特异性扩增的关键在于优化实验条件和采取一些特定的策略。以下是一些有效的方法:1.**优化引物设计**:引物设计是PCR成功的关键。应确保引物序列具有高度特异性,避免与非目标序列互补。使用在线工具进行引物设计,并进行BLAST搜索以确认特异性。2.**使用热启动PCR**:热启动PCR技术可以抑制室温下的DNA聚合酶活性,减少非特异性扩增。这种方法通过在高温下激起酶的活性,从而在PCR体系配制阶段降低引物与模板或引物与引物之间的非特异性结合。3.**调整Mg2+浓度**:Mg2+浓度对PCR扩增的特异性和产量有重要影响。过高的Mg2+浓度可能导致非特异性扩增,因此需要优化Mg2+浓度以获得比较好的结果。4.**退火温度优化**:退火温度对PCR特异性至关重要。较高的退火温度有助于减少非特异性结合,但过高的退火温度可能会降低引物与模板的结合效率。通常,退火温度设置比引物的Tm值低5°C左右。5.**使用降落PCR**:降落PCR(TouchdownPCR)通过在初始循环中使用较高的退火温度,然后逐渐降低退火温度,从而在PCR开始时减少非特异性扩增,同时在后续循环中保持特异性扩增。
BsuDNAPolymerase(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶)与其他DNA聚合酶相比,具有一些独特的特性和优势:1.**链置换活性**:BsuDNAPolymerase保留了BacillussubtilisDNA聚合酶I的5'→3'聚合酶活性,但缺乏5'→3'核酸外切酶结构域,这使得它具有链置换DNA合成的能力。这种能力对于等温扩增技术如重组酶聚合酶扩增(RPA)和环介导等温扩增(LAMP)非常重要,因为它可以分离双链DNA,允许新的DNA链的合成。2.**温度稳定性**:BsuDNAPolymerase在高温下保持活性,这使得它适用于需要在较高温度下进行的扩增反应,如RPA技术中的65°C反应条件。3.**无核酸外切酶活性**:BsuDNAPolymerase缺乏3'→5'和5'→3'核酸外切酶活性,这意味着它不会像某些其他聚合酶那样在合成过程中具有校对功能。这可以减少非特异性扩增,提高扩增的特异性。4.**高灵敏度和特异性**:BsuDNAPolymerase在等温扩增中展现出高灵敏度,能够将微量核酸模板扩增到可检测水平,同时保持高特异性。5.**简化的操作流程**:与其他需要复杂操作和多个步骤的DNA聚合酶相比,BsuDNAPolymerase在等温扩增技术中的应用简化了操作流程,因为它不需要热循环仪,这使得它适合现场快速检测和诊断。
牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)与细菌DNA拓扑异构酶的主要区别如下:1.**来源不同**:-牛痘DNA拓扑异构酶I来源于牛痘病毒,是一种真核生物病毒中的酶。-细菌DNA拓扑异构酶则来源于原核生物,如大肠杆菌的ω蛋白等。2.**功能特性**:-牛痘DNA拓扑异构酶I能够解旋DNA的超螺旋结构,并且识别并切割双链DNA末端[5’C(T)CCTT],与DNA形成共价连接形成稳定复合物,遇到DNA的5’-OH基团后,重新连接形成完整DNA链。-细菌DNA拓扑异构酶,如大肠杆菌的ω蛋白,主要功能是催化DNA链断开和结合的偶联反应,以改变DNA的拓扑结构。3.**活性条件**:-牛痘DNA拓扑异构酶I即使在Mg2+不存在的条件下也显示活性。-细菌DNA拓扑异构酶可能需要Mg2+等金属离子作为辅因子来发挥活性。4.**作用的DNA链**:-牛痘DNA拓扑异构酶I能使正负两方的超螺旋分子均形成松散型。-原核生物由来的DNA拓扑异构酶I只作用负链的超螺旋分子。5.**共价键形成**:-牛痘DNA拓扑异构酶I与DNA形成共价连接,此酯键中所贮存的能量可能在切断端的再结合上起着作用。-细菌DNA拓扑异构酶在原核生物中是游离型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端与酶形成共价键。
Cas12a同源物能够识别更简单的PAM序列(如5-TTN),这使得基因组的覆盖率显著提高。Recombinant Mouse PSGL-1 Protein,His Tag
FnCas12a可以识别不同的PAM序列,例如5'-TTN-3',这增加了它可以靶向的基因组区域 。Recombinant Human sCD23
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一种来自大肠杆菌的DNA损伤修复酶,具有以下特点:1.**双功能活性**:核酸内切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**释放受损嘧啶碱基**:N-糖基化酶活性可以释放双链DNA上受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一个脱嘌呤(apurinic,AP)位点。3.**切割AP位点**:AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。4.**识别并切除受损碱基**:核酸内切酶VIII可以识别并切除多种受损碱基,包括尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲。5.**与EndonucleaseIII的区别**:虽然核酸内切酶VIII与核酸内切酶III相似,但核酸内切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸内切酶III具有β裂解酶活性。6.**应用领域**:核酸内切酶VIII可以应用于单细胞凝胶电泳、NGS建库中DNA损伤修复、酶法合成DNA中释放DNA链、碱洗脱,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)进行含U片段的克隆等。
Axltide
Recombinant Mouse BD-3
Recombinant Human FGFR1 alpha (IIIc) Protein
Recombinant Human Fc gamma RIIIB/CD16b (NA1)(His Tag)
Recombinant Human SIRP alpha/CD172a(His Tag)
Recombinant Mouse GDF15 Protein
Recombinant Human GPRC5D Protein-VLP
Recombinant Human IGF-BP5
Recombinant Human TNFSF15 Protein
RNA纯化磁珠